david james sherman

david james sherman sherman david james bureau : labri 214 telephone : +33 540 00 6922 mél : david.sherman@labri.fr maître de conférences (hdr), enseirb, actuellement en délégation au cnrs voir aussi labri cbib génolevures intact hupo psi enseirb étudiants r. barriot e. beyne h. ferry-dumazet f. iragne i. lesur équipe modélisation, vérifications et test de systèmes informatiques projet transversal algorithmes et méthodes pour la bioinformatique recherche mes recherches actuelles portent sur la compréhension des multiples relations entre les gènes et les protéines participant à la vie cellulaire, à travers le développement de méthodes et outils en bioinformatique pour la génomique comparée et pour la protéomique. ces développements ont pour cadre deux gros projets, le projet national génolevures (gdr 2354), et le projet européen intact (temblor). publications récentes durrens p., sherman d., a systematic nomenclature for chromosomal elements in hemiascomycete yeasts. yeast à paraître, 2005 iragne f., nikolski m., mathieu b., auber d., sherman d., proviz: protein interaction visualisation and exploration, bioinformatics, advance access publication, 2004 dujon b., sherman d., fischer g., durrens p., et al (65 auteurs), genome evolution in yeasts. nature 430(6995), pp.35-44, 2004 sherman d., durrens p., beyne e., nikolski m., souciet j.l.; genolevures consortium, génolevures: comparative genomics and molecular evolution of hemiascomycetous yeasts. nucleic acids res. 32, pp.d315-8, 2004 barriot r., poix j., groppi a., barré a., goffard n., sherman d., dutour i., de daruvar a., new strategy for the representation and the integration of biomolecular knowledge at a cellular scale. nucleic acids res. 32(12), pp.3581-3589, 2004 hermjakob h., montecchi-palazzi l., bader g., wojcik j., salwinski l., ceol a., moore s., orchard s., sarkans u., von mering c., roechert b., poux s., jung e., mersch h., kersey p., lappe m., li y., zeng r., rana d., nikolski m., husi h., brun c., shanker k., grant s.g., sander c, bork p., zhu w., pandey a., brazma a., jacq b., vidal m., sherman d., legrain p., cesareni g., xenarios i., eisenberg d., steipe b., hogue c., apweiler r., the hupo psi's molecular interaction format -- a community standard for the representation of protein interaction data. nature biotechnology 22, pp.177-83, 2004 hermjakob h., montecchi-palazzi l., lewington c., mudali s., kerrien s., orchard s., vingron m., roechert b., roepstorff p., valencia a., margalit h., armstrong j., bairoch a., cesareni g., sherman d., apweiler r., intact: an open source molecular interaction database. nucleic acids res. 32, pp.d452-5, 2004 orchard s., hermjakob h., julian r.k. jr, runte k., sherman d., wojcik j., zhu w., apweiler r., common interchange standards for proteomics data: public availability of tools and schema. proteomics 4(2), pp.490-1, 2004 de hertogh b., talla e., tekaia f., beyne e., sherman d., baret p.v., dujon b., goffeau a., novel transporters from hemiascomycete yeasts, j mol microbiol biotechnol. 6, pp.19-28, 2003 responsabilités membre du conseil de laboratoire membre du conseil scientifique membre de la commission communication membre de la commission de spécialistes 27ème à l'université bordeaux 3 (suppléant g. eyrolles) co-responsable, projet transversal ambi responsable, aci impbio génolevures en ligne responsable pour la bioinformatique au gdr génolevures membre du sgd advisory board (stanford university/national institutes of health), 2004 comité de programme sfc (société francophone de classification) 2004 comité de programme jobim (journées ouvertes biology, informatique et mathématiques) 2005

david james sherman  Précédent 369  Précédent 368  Précédent 367  Précédent 366  Précédent 365  Précédent 364  Précédent 363  Précédent 362  Précédent 361  Précédent 360  Précédent 359  Précédent 358  Précédent 357  Précédent 356  Précédent 355  Précédent 354  Précédent 353  Précédent 352  Précédent 351  Précédent 350  Précédent 349  Précédent 348  Précédent 347  Précédent 346  Précédent 345  Précédent 344  Précédent 343  Précédent 342  Précédent 341  Précédent 340  Suivant 371  Suivant 372  Suivant 373  Suivant 374  Suivant 375  Suivant 376  Suivant 377  Suivant 378  Suivant 379  Suivant 380  Suivant 381  Suivant 382  Suivant 383  Suivant 384  Suivant 385  Suivant 386  Suivant 387  Suivant 388  Suivant 389  Suivant 390  Suivant 391  Suivant 392  Suivant 393  Suivant 394  Suivant 395  Suivant 396  Suivant 397  Suivant 398  Suivant 399  Suivant 400